A crioablação pode ser usada no tratamento da fibrilação atrial com taxas de sucesso semelhantes à da radiofrequência, mas sua principal vantagem é no tratamento de arritmias que se originam muito próximo ao sistema de condução normal. Nessas arritmias o uso da radiofrequência é mais arriscado por que pode causar lesões irreversíveis no sistema de condução levando a bloqueios e possibilidade de implante de marcapasso definitivo.
Através do ‘criomapping’ pode-se testar o melhor local de aplicação e a lesão resultante será reversível. Dessa forma o tratamento de tais arritmias passa a ser mais seguro.
As principais arritmias em que há indicação preferencial pela crioablação são: Síndrome de Wolf Parkinson White em que a via acessória é parahissiana (anteroseptal ou medioseptal direita), extrassístoles juncionais e extrassístoles ventriculares parahissianas. Há ainda a possibilidade de uso para taquicardia por reentrada nodal, principalmente em crianças. Ou seja, nesses casos em que há risco no uso da radiofrequência a opção pela crioablação é mais segura.
Em algumas situações o diagnóstico da localização exata da origem da arritmia só ocorre após a realização do estudo eletrofisiológico. Nessas situações é agendado um segundo procedimento para tratamento, utilizando a crioablação.
Embora nesses casos a crioablação tenha a vantagem de ser mais segura ela possui menor taxa de sucesso e maior taxa de recorrência e por isso seu uso geralmente é limitado a situações bem indicadas.